EESK har sex facksektioner som är specialiserade på specifika frågor av relevans för medborgarna i Europeiska unionen, alltifrån sociala och ekonomiska frågor till energi, miljö, utrikespolitik eller den inre marknaden. Ledamöterna deltar i en eller flera av dessa facksektioner beroende på deras särskilda kompetensområden och det är här som mycket av det förberedande arbetet med yttrandena utförs. Kommittén har också ett rådgivande utskott för industriell omvandling (CCMI), som hjälper EU:s näringsliv att förutse och anpassa sig till konsekvenserna av globaliseringen.
EESK har följande facksektioner/utskott:
- Ekonomiska och monetära unionen, ekonomisk och social sammanhållning – ECO
- Inre marknaden, produktion och konsumtion – INT
- Transporter, energi, infrastruktur och informationssamhället – TEN
- Yttre förbindelser – REX
- Jordbruk, landsbygdsutveckling och miljö – NAT
- Sysselsättning, sociala frågor och medborgarna – SOC
- Rådgivande utskottet för industriell omvandling – CCMI
EESK har även inrättat tre särskilda observationsgrupper – för den inre marknaden (OIM), för arbetsmarknaden (OAM) och för hållbar utveckling (OHU) – samt en styrgrupp för EU:s Europa 2020‑strategi för tillväxt och sysselsättning.
En kontaktgrupp har inrättats som samverkar med europeiska organisationer och nätverk i det civila samhället och följer upp gemensamma initiativ.