ETSK:ssa on kuusi erityisjaostoa, jotka ovat erikoistuneet tiettyihin, Euroopan unionin kansalaisten kannalta merkityksellisiin aiheisiin. Ne vaihtelevat sosiaaliasioista talousasioihin, energia- ja ympäristökysymyksiin, ulkosuhteisiin ja sisämarkkinoihin. Jäsenet kuuluvat yhteen tai useampaan erityisjaostoon asiantuntemuksensa mukaisesti. Jaostoissa tehdään suuri osa lausuntojen valmistelutyöstä. ETSK:ssa on myös neuvoa-antava valiokunta ”teollisuuden muutokset” (CCMI), joka auttaa EU:n teollisuutta ennakoimaan globalisaation vaikutuksia ja mukautumaan niihin.
ETSK:n erityisjaostot/valiokunta ovat seuraavat:
- talous- ja rahaliitto, taloudellinen ja sosiaalinen yhteenkuuluvuus – ECO
- yhtenäismarkkinat, tuotanto ja kulutus – INT
- liikenne, energia, perusrakenteet, tietoyhteiskunta – TEN
- ulkosuhteet – REX
- maatalous, maaseudun kehittäminen, ympäristö – NAT
- työllisyys, sosiaaliasiat, kansalaisuus – SOC
- neuvoa-antava valiokunta ”teollisuuden muutokset” – CCMI
ETSK:ssa on myös kolme seurantaryhmää – yhtenäismarkkinoiden, työmarkkinoiden ja kestävän kehityksen seurantaryhmät – sekä kasvua ja työllisyyttä koskevaa EU:n Eurooppa 2020 -strategiaa käsittelevä ohjauskomitea.
Lisäksi on perustettu yhteysryhmä, joka toimii vuorovaikutuksessa kansalaisyhteiskunnan eurooppalaisten organisaatioiden ja verkostojen kanssa ja seuraa yhteisiä aloitteita.