El CESE cuenta con seis secciones especializadas en temas específicos de interés para los ciudadanos de la Unión Europea, que van desde los asuntos sociales a los económicos, pasando por la energía, el medio ambiente, las relaciones exteriores o el mercado interior. Los miembros participan en una o varias de estas secciones en función de sus áreas de especialización, y es en ellas donde se realiza gran parte del trabajo de base de los dictámenes. El CESE cuenta también con una Comisión Consultiva de las Transformaciones Industriales (CCMI), que ayuda a la industria de la UE a anticiparse y adaptarse al impacto de la globalización.
Las secciones y la comisión del CESE son las siguientes:
- Unión Económica y Monetaria y Cohesión Económica y Social – ECO
- Mercado Único, Producción y Consumo – INT
- Transportes, Energía, Infraestructuras y Sociedad de la Información – TEN
- Empleo, Asuntos Sociales y Ciudadanía – SOC
- Agricultura, Desarrollo Rural y Medio Ambiente – NAT
- Relaciones Exteriores – REX
- Comisión Consultiva de las Transformaciones Industriales – CCMI
El CESE también ha constituido tres observatorios especializados —sobre la transición digital y el mercado único (OMU), el mercado de trabajo (OMT) y el desarrollo sostenible (ODS)—, amén del Grupo del Semestre Europeo (GSE) y el Grupo ad hoc sobre Derechos Fundamentales y Estado de Derecho.
También se ha creado un Grupo de Enlace para interactuar con las organizaciones y redes europeas de la sociedad civil y efectuar un seguimiento de las iniciativas conjuntas.